Vid Nilens stränder tvärs över floden från Thebe(Luxor), fann man ett tempel i tre etage under hundratals ton av sand, hundratals sekel efter dess uppförande. Templet är en spegelbild av Mentuhotep II:s gravtempel och byggdes efter elfte dynastins byggnadsstruktur. Emellertid är Hatshepsuts tempel långt större än Mentuhoteps. Arkitekten var Senmut, Hatshepsuts älskare,gemål och medlem av hennes hov med mer än 20 titlar. Senmut designade templet med rader av kolonner som speglar det vertikala mönstret från klippsluttningen bakom. På detta sätt var templet ett framgångsrikt exempel på arkitektonisk harmoni mellan människan och naturen. Templet är tillägnat gudarna Amon och Hathor, Hatshepsuts påstådda föräldrar, även om där finns kapell tillägnade andra gudar, som Anubis, balsameringsguden. Helgedomen ligger ytterst nära bergets sida. Två ramper förbinder de tre etagen och på vardera insidan av den låga sluttningen fanns T-formade papyrus-hållare. På det nedersta etaget fanns sfinxer och väldoftande träd från Punt(Somalia). Alla sfinxerna hade huvuden som avbildade Hatshepsut och hon är också representerad som ett lejon på några av templets relieffer. Även om hon inte hade några speciella fiender, visas hon klösandes mot motståndare och fångandes "ondskans fåglar" i ett fågelnät. Vidare dokumenterar templets väggar: Hatshepsuts gudomliga föreställning; hennes förtroendevotum hon fått av sin fader; hennes försök att reparera skador som tillfogats av Hyksos invasion; expeditionen till Punt(Somalia) och resandet av de kolossala obeliskerna vid templet i Karnak. Eftersom byggandet av komplexet tog omkring 20 år, var väggarna som en bok med blanka sidor som fylldes i under tiden hennes regim fortskred. Vid tiden för templets färdigställande, hade Hatshepsut förmodligen ingen tid att njuta av det som farao. Även om Senmut planerat att bli begraven där var det ödesbestämt att Hatshepsuts grav skulle hamna någon annanstans. På samma sätt som hennes fader, Tuthmose I, som insåg att ett tempel var för uppenbart för att placera värdefulla skatter i, blev Hatshepsuts grav byggd i hemlighet. Ineni, Tuthmose I:s arkitekt till grav och tempel, skröt om sig själv att han var den ende som kände till var hans mästares grav låg. De 100 "slavar" som hade byggt graven, enligt legenden, dödades efter projektet för att bevara hemligheten. Huruvida denna brutala teknik användes i Hatshepsuts fall är inte känt, men är ganska omtvistat. Den största fiende Hatshepsut hade var inte gravplundrare utan hennes egen brorson, som utan problem skulle hitta hennes grav, oberoende av hur många slavar som dog.